La MAPES est juridiquement rattachée au CHU de Nantes et est hébergée physiquement au CHU de Nantes et au Centre Les Capucins à Angers.
L’action de la MAPES est supervisée par un Comité de Pilotage, et mise en oeuvre sous l’autorité de son Directeur.
Les organismes représentés au Comité de Pilotage sont détaillés ci-dessous: